Самостійне зберігання визначає, як активи зберігаються на STONfi. У DeFi власність не припускається, вона забезпечується через самостійне зберігання. На STONfi користувачі не передають контроль над своїми активами платформі. Замість цього вони взаємодіють безпосередньо зі своїх гаманців, зберігаючи повний контроль над своїми коштами на кожному кроці. Структура проста. Користувачі підключають гаманець, затверджують транзакції та виконують обміни або дії з ліквідністю без внесення активів у централізовану систему. Це змінює спосіб розподілу ризику. Замість покладанняся на третю сторону для захисту коштів відповідальність залишається за користувачем. Активи залишаються у гаманці, а доступ визначається виключно приватними ключами. Самостійне зберігання також впливає на спосіб взаємодії користувачів із протоколом. Кожна дія — від обміну до фермерства — базується на дозволах, а не на зберіганні. Це дозволяє брати участь без створення облікового запису або зовнішнього схвалення. Водночас це вводить інший рівень відповідальності. Безпека, резервне копіювання та управління ключами стають важливими частинами досвіду. Відновлювальний механізм, прив’язаний до ідентичності, відсутній — лише доступ до облікових даних, контрольованих користувачем. На STONfi самостійне зберігання — це не додаткова функція, а основа, яка визначає, як зберігаються активи, як виконуються транзакції та як користувачі взаємодіють із DeFi.